肥料登记证续展之前，申请人应当向登记试验所在地省级农业部门备案。备案信息包括备案人，产品概述，试验项目，试验地点，试验单位，试验时间，安全防范措施等。第十八条农业部对申请人提交的续展变更申请资料，应当根据下列情况分别作出处理。

农业部肥料登记评审委员会秘书处核验申请人提交的肥料变更申请样品。对企业生产条件进行考核省级农业主管部门受理辖区肥料生产企业肥料登记申请申请资料齐全符合法定形式且肥料样品符合要求的予以受理。提出初审意见。农业部行政审批办公大厅肥料窗口审查申请人递交的肥料登记相关资料。

肥证作物增项，也是在原有作物的基础上，针对增项目标作物做相关材料进行上报，农业部行政审批办公大厅肥料窗口审查申请人递交的肥料作物增项登记相关资料。